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尧小飞/targetSeqView

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Package: targetSeqView
Title: View alignments over candidate structural variant loci
Version: 0.99.2
Date: 2014-08-23
Author: Eitan Halper-Stromberg
Maintainer: Eitan Halper-Stromberg <Eitan177@gmail.com>
Description: View putative alignments for loci involved in structural rearrangements
License: GPL (>= 2)
LazyLoad: yes
Depends: R (>= 2.14), foreach, Rsamtools, GenomicRanges,
Biostrings,IRanges, BSgenome, BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,
ggplot2, doMC, grid
Ehhances: doMC
Collate: targetSeqView_functions.R alignQuick.R alignViewFull.R
getErrorRate.R ViewAndScoreFull.R doQuickScore.R quickScore.R quickSplits.R formatPlot.R
methods.R
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https://gitee.com/yao_xiao_fei2/targetSeqView.git
git@gitee.com:yao_xiao_fei2/targetSeqView.git
yao_xiao_fei2
targetSeqView
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